Iratkozz fel a blogra!

Magamról

Barta Endre vagyok, molekuláris biológus, bioinformatikus.

A célom ezzel a bloggal, hogy a saját szemszögemből bemutassam a genomikát.

Különböző rovatokat tervezek, így a napi és a heti hírek, a napi és a heti genomok, a miaza rovatot, amiben a genomika fogalmait próbálom bemutatni, és mivel elég későn csatlakoztam, lesznek retrospektív posztok is. Szeretnék néha egy kicsit provokatív is lenni és így érdemi vitákat generálni a szakmában és más érdeklődők között is.

E-mail: endre.barta [at] gmail.com

Friss topikok

  • madbal: Kedves Endre! En azt az informaciot talaltam, hogy a szekvenalas 454 technologiaval tortent, www.m... (2011.09.23. 15:19) Kender genomszekvenálás
  • attila.szanto: Szia Endre! Gratulalunk a bloghoz, nagyon szinvonalas es erdekes. Sok sikert hozza! (2010.05.01. 20:36) Mi az a referencia genom?

Utolsó kommentek

  • madbal: Kedves Endre! En azt az informaciot talaltam, hogy a szekvenalas 454 technologiaval tortent, www.m... (2011.09.23. 15:19) Kender genomszekvenálás
  • attila.szanto: Szia Endre! Gratulalunk a bloghoz, nagyon szinvonalas es erdekes. Sok sikert hozza! (2010.05.01. 20:36) Mi az a referencia genom?
  • Utolsó 20

Címkék

Linkblog

Neandervölgyi genom

2010.05.07. 00:27 :: ebarta

Minden azzal van tele, hogy egy lipcsei vezetésű tudós csapat meghatározta a neandervölgyi ősember genomját, amit a Science-ben publikáltak. Persze a "breaking news" nem ez, hanem hogy bebizonyították, azt hogy mégiscsak történt kereszteződés a mi közvetlen őseink és a neandervölgyiek között. Jobban mondva az eurázsiai ág és a neandervölgyiek között (tehát az afrikai népek mentesek maradtak a neandervölgyi "vérfrissítéstől"). A mai eurázsiai genomok így tartalmaznak 1-2 százaléknyi neandervölgyi allélt. Mondjuk az eddigi, ezzel ellentétes bizonyítékok ugye mitokondriális szekvenciákon alapultak, ami csak azt bizonyíthatja, hogy eleink nem raboltak szabin, akarom mondani neandervölgyi nőket. Azt nem, hogy a neandervölgyi férfiak nem jártak át eleinkhez ...

A részletekről majd később még szeretnék írni, most csak egy-két fontosabb tény a szenzáción kívül:

  • A csontokból kivont DNS nagy része mikrobiális eredetű, és van sok modern humán szennyeződés is, ezért speciális mintaelőkészítő módszereket dolgoztak ki.
  • 454 és Illumina gépekkel szekvenáltak, a leolvasott DNS-t a modern humán és a csimpánz genomra is illesztették.
  • Ha a humán csimpánz szétválás 6.5 millió évvel ezelőtt volt, akkor a humán neandervölgyi szétválás 850 ezer éve
  • Az eredmény az összehasonlító genomika szép példája, az összehasonlítás kedvéért  például "mellékesen" megszekvenáltak (igaz csak alacsony lefedettséggel) öt emberi genomot is.
  • Új tudományágat kell megszoknunk, a paleogenetikát, vagy paleogenomikát
  • A Science-ben megjelent cikkeket általában nagyon nehéz letölteni (az érdekesebb cikekket például először csak a ScienceExpress-re külön előfizetők olvashatják), de most nem csak hogy szabadon letölthető az anyag, hanem még külön oldalakat is létrehoztak, ahol összegzik az eredményeket (lásd a fenti linket)

 

Szólj hozzá!

Címkék: 454 napihír illumina paleogenomika

A bejegyzés trackback címe:

https://genomika.blog.hu/api/trackback/id/tr341980488

Kommentek:

A hozzászólások a vonatkozó jogszabályok  értelmében felhasználói tartalomnak minősülnek, értük a szolgáltatás technikai  üzemeltetője semmilyen felelősséget nem vállal, azokat nem ellenőrzi. Kifogás esetén forduljon a blog szerkesztőjéhez. Részletek a  Felhasználási feltételekben és az adatvédelmi tájékoztatóban.

Nincsenek hozzászólások.